10x Genomics Visium将基因空间表达可视化，，在识别不同细胞群的同时保留空间背景，，，提供了关于组织微环境中细胞功能、、表型和位置关系的关键信息，，，，为基因表达和组织复杂性研究提供了一个新视角。。。
将冰冻组织切片放置在10X Genomics Visium芯片的的捕获区域内，，，，进行HE染色和成像后，，对组织切片进行透化处理，，，细胞内的mRNA释放，，，，从而被芯片上带有oligo-dT的探针捕获，，并且每个探针都带有特异的地址序列，，然后以mRNA为模版进行cDNA合成，，构建文库后进行测序，，，，从而能够获得基因表达的位置信息。。。
Visium空间基因表达玻片信息
Visium芯片有4个捕获区域，，，每个区域大小为6.5mm *6.5mm，，，，每个spot直径为55um，，包含数百万个用于捕获的oligo探针序列，，，，相邻两个spot点的中心距离为100um。。。探针序列的结构为：测序引物结合序列，，，16 nt spatial barcoded，，12 nt UMI及30 nt oligo-dT序列。。
样本起始量与送样建议
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组织类型 |
样本收集 |
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OCT包埋冰冻组织/白片/切片 |
制备 OCT包埋冰冻组织块，，建议组织大小为长×宽不超过 6.5mm×6.5mm，，，，高度≥5mm；
白片或贴片建议准备6-13 片（10μm 厚度）。。。
封装好用干冰进行寄送。。。。 |
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FFPE包埋组织/白片/切片 |
石蜡包埋组织封装好后，，4℃进行寄送。。。。
石蜡包埋白片或贴片建议准备6-13 片（5μm 厚度），，，4℃进行寄送。。。 |
注意事项：详细样本准备指南，，，，请联系在线客服。。。
生物信息学分析内容
